DNA甲基化是一種表觀遺傳修飾,它是由DNA甲基轉移酶(DNA methyl-transferase, Dnmt)催化S-腺苷甲硫氨酸作為甲基供體,將胞嘧啶轉變?yōu)?-甲基胞嘧啶(mC)的一種反應,在真核生物DNA中,5-甲基胞嘧啶是唯一存在的化學性修飾堿基。CG二核苷酸是最主要的甲基化位點,它在基因組中呈不均勻分布,存在高甲基化、低甲基化和非甲基化的區(qū)域,在哺乳動物中mC約占C總量的2-7%。一般說來,DNA的甲基化會抑制基因的表達。DNA的甲基化對維持染色體的結構、X染色體的失活、基因印記和腫瘤的發(fā)生發(fā)展都起重要的作用。
BSP法原理:用亞硫酸氫鈉修飾處理基因組DNA,所有未發(fā)生甲基化的胞嘧啶(C)被轉化為尿嘧啶(U)而甲基化的胞嘧啶則不變?;蚪MDNA經亞硫酸鹽處理后,設計BSP引物擴增目的片段,此時尿嘧啶(U)全部轉化為胸腺嘧啶(T),最后對PCR產物進行測序就可以判斷CpG位點是否發(fā)生甲基化。
服務價格
服務編號
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服務內容
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價格
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周期
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CWS024
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PCR產物直接測序
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¥1198/樣品
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1周
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服務內容
1. 基因組DNA的Bisulfite轉化。
2. BSP(Bisulfite Sequencing PCR)法,PCR產物直接測序,包括引物設計,不包括合成。
樣品要求
·若提供基因組DNA,需≥2ug。
·若提供的材料為新鮮組織、血液、細胞等生物材料,請?zhí)峁┳銐蛱崛?ug以上基因DNA的材料量。
·基于所選擇的DNA甲基化檢測方法,請?zhí)峁┫鄳囊锘蛞镄蛄小?
終產品
·Bisulfite處理的基因組DNA;
·實驗報告(包括BSP產物的直接測序報告)。
服務說明
·在基于Bisulfite 轉化的DNA甲基化檢測的方法中,引物是決定實驗成敗的關鍵因素,且視期望檢測的目的基因片段的不同,適宜引物的存在與否有較大的不確定性,請盡量采用其可行性經過驗證的引物,如因引物等非本公司原因導致某實驗步驟失敗,使服務提前終止,已啟動的實驗項目正常收費。若需DNA甲基化檢測用引物設計服務,價格另議。
·視BSP產物序列的不同,采用直接檢測有可能導致實驗結果的可靠性降低;視BSP引物特異性的不同,BSP產物的克隆測序存在插入片段與目的片段不符合的可能性,建議選擇同時對多個克?。?gt;15個)進行測序,以獲得足夠的數(shù)據(jù)用于后期分析,最后提供客戶5個有效克隆測序結果。